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首届PEAKS中国用户大会暨第四届PEAKS 蛋白质组学数据分析培训班在魔都上海圆满落幕!

2019年12月2日-3日,由豆谷科技与PEAKS算法的开发者Bioinformatics Solutions Inc联合举办的首届PEAKS中国用户会暨第四届PEAKS蛋白质组学培训班在上海好望角大酒店五楼长恭厅举办。本次用户大会邀请了业内知名的来自北大医学部的黄超兰教授,中国农业科学院蜜蜂研究所的李建科教授,以及复旦大学的乔亮教授作为PEAKS资深用户分享了他们的工作、研究经验及与PEAKS携手科研的故事。同时,豆谷科技也特别邀请了PEAKS算法的开发者——加拿大皇家科学院院士、滑铁卢大学的李明教授分享了他们AI团队最前沿的算法应用,以及如何将计算机科学与生命科学相结合来解决问题。此外,BSI的CEO单宝珍博士和豆谷科技的高级应用工程师李文婷,分别为与会人员详细讲述了PEAKS软件的算法、应用和本地部署、云计算方案等内容。

PEAKS系列软件自进入中国蛋白质组学的科研领域以来,一直与豆谷科技携手共同为中国的科研、企业用户提供紧跟蛋白质组学技术前沿发展的软件和优质的技术支持。在本次用户大会当天,单博士为与会的PEAKS新老朋友介绍了PEAKS大家庭的成员,BSI的公司理念与使命。来自Waterloo University 的计算科学与数学团队为PEAKS软件的开发提供了算法核心,这也是BSI自2000年成立以来,一直走在行业前列的秘籍。他们曾连续三年在PNAS、Nature Method等期刊发表利用deep learning的方法解决de novo sequencing精确度和灵敏度的问题,同时也是首次提出对DIA数据构建de novo模型的算法团队。

紧接着,PEAKS的老朋友,来自中国农业科学院蜜蜂研究所的李建科教授为大家介绍了他们团队在蜜蜂蛋白质组学的研究进展与成果。自2005年蜜蜂蛋白质组学创立以来,李教授带领团队,发表关于蜜蜂蛋白质组的文章占到国际该领域文章总量的近乎一半。相当多的成果都与我们PEAKS软件有着密切的关系,特别是在缺乏蛋白序列数据库时,PEAKS的核心算法de novo就起到了很大作用。

来自北京大学医学部的黄超兰教授在单细胞蛋白质组学方法的建立方面,同样做出了令人瞩目的成果。在用其他方法没有办法获得更高的谱图解析率以解决低丰度肽段的鉴定问题时,黄超兰教授借助PEAKS强大的质谱数据分析能力,得到了灵敏度高且结果可靠的单细胞蛋白组结果。在首届欧洲单细胞蛋白质组学会议上,黄教授分享了他们团队关于的单细胞蛋白组鉴定方面的经验,同时他们团队的方法也被认可为目前能够获得最多的蛋白ID信息的方法。由于该工作有部分结果尚未发表,因此未做展示,让我们一起期待黄老师的文章!

来自复旦大学的乔亮教授,在他近期的应用多组学对人造光合成系统研究的文章中,也同样应用PEAKS的软件完成了蛋白质组学部分的数据分析,包括质控、定性、定量和差异蛋白筛选,并且成功发表在Cell子刊上。

作为PEAKS算法开发者,著名的计算科学家李明教授为大家分享了他们AI团队最新的研究方向与进展,将AI技术应用在个性化癌症免疫治疗,帮助减少传统方法漫长的治疗时间 以及高昂的费用。借用参会嘉宾的话说:李教授的精彩报告让人大开眼界。

PEAKS首届用户会暨第四届PEAKS 蛋白质组学数据分析培训班在交流讨论声中圆满落下帷幕,希望我们PEAKS大家庭的每一位成员在这次首届和培训班中收获颇丰,也感谢大家对我们的信任与支持。让我们期待明年再次相聚!

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